Le Mozambique analyse les eaux usées pour détecter les menaces liées aux maladies

By The Global Fund

October 9^th, 2023

Le Dr Diocreciano Matias Bero, chercheur en santé, dirige le programme de surveillance environnementale des eaux usées à l’Institut national de la santé du Mozambique.

Il reconnaît que la plupart des personnes sont rebutées par ce qui est rejeté dans les toilettes – mais l’étude des eaux usées est, pour lui, une passion.

« Personne ne voulait étudier les échantillons malodorants », dit-il. « Mais c’est là que se trouvent les informations les plus précieuses. »

Dans divers pays du monde, l’analyse des eaux usées permet de déterminer si un virus ou une bactérie se propage dans une communauté, en amont d’une flambée épidémique de grande ampleur. Il est ainsi possible de savoir où un agent pathogène circule avant que des gens tombent malades, ce qui permet aux décisionnaires d’agir plus vite pour contenir une maladie et éviter sa propagation.

Pendant la pandémie de COVID-19, des pays analysaient leurs eaux usées pour détecter les fortes concentrations de SARS-CoV-2 et suivre l’évolution de ce virus.

Le Fonds mondial soutient des programmes d’analyse des eaux usées dans six pays d’Afrique de l’Est et d’Afrique australe, y compris au Mozambique, en vue d’une détection précoce des maladies.

Le Dr Diocreciano Matias Bero, chercheur en santé

Le Mozambique analyse les eaux usées pour détecter les menaces liées aux maladies

Le Dr Bero et son équipe ont mis en place le programme de surveillance environnementale des eaux usées l’année dernière. Ils collectent et analysent des échantillons quatre fois par semaine, et ce système de surveillance précoce permet de détecter les flambées épidémiques.

L’équipe respecte plusieurs mesures de sécurité pendant le prélèvement d’échantillons ; elle utilise notamment un équipement de protection individuelle pour assurer sa sécurité et éviter la contamination des échantillons qu’elle prélève.

Les quatre membres de l’équipe sont (de gauche à droite) les techniciennes de laboratoire Delfa Nhiuane et Loira Machalele, le responsable technique de laboratoire Helder Simeao Chaigue et le Dr Bero.

L’une des premières étapes de l’analyse des eaux usées consiste à identifier les sites de collecte d’échantillons.

À l’heure actuelle, l’équipe prélève des échantillons sur quatre sites à Maputo, la capitale du Mozambique. Ces sites sont des lieux où les débits d’eaux usées sont importants et des sites d’intérêt particuliers, notamment à proximité d’une usine de traitement des eaux usées, d’un marché très fréquenté et d’un stade.

Une fois les sites déterminés, le Dr Bero et son équipe mettent en place des « pièges » pour collecter les échantillons. Ces pièges sont fabriqués avec une gaze spéciale qui retient les particules présentes dans les eaux usées. L’équipe les utilise aux quatre emplacements désignés et les laisse en place 24 heures.

Passé ce délai, elle collecte les échantillons qu’elle achemine vers un laboratoire de l’Institut national de la santé dans la ville de Marracuene, à 30 kilomètres environ au nord de Maputo.

Les échantillons doivent être réfrigérés pendant leur transport et conservés à une température comprise entre 4 et 8 degrés Celsius pour préserver leur intégrité.

Au laboratoire, les analyses recherchent le SARS-CoV-2 (le virus à l’origine du COVID-19), ainsi que certaines souches de grippe dans les échantillons. Les premiers résultats sont disponibles très vite, au bout de 24 heures.

« Avant que les cas commencent à se répandre dans la communauté, nous savons déjà que c’est l’agent « X » qui circule... et nous pouvons facilement prendre des mesures préventives », explique le Dr Bero.

Dès l’année prochaine, le programme sera élargi à 15 sites supplémentaires.

D’après le Dr Bero, cet élargissement est vital, en particulier parce que le Mozambique est davantage exposé aux risques de flambées épidémiques liées au changement climatique.

« [Nous] sommes vulnérables au changement climatique, et les pluies provoquent des inondations », explique-t-il. « Si un programme est déjà en place, nous pouvons détecter la présence du choléra, d’un rotavirus ou d’un norovirus, ou identifier l’agent qui circule dans la communauté et provoque des diarrhées. Il est extrêmement important pour le pays d’élargir ce programme. »

Chaque année, le Fonds mondial investit environ 1,5 milliard de dollars US dans la mise en place de systèmes résistants et pérennes pour la santé, notamment dans des systèmes d’alerte rapide qui contribuent à identifier des menaces sanitaires futures et à s’y préparer.